Bir zamanlar "bilgelik çalışması" olarak bilinen çıkarım faaliyetleri yoluyla acı bir deneyim yaşayan Kobato, dürüst ve alçakgönüllü bir vatandaş olmaya kararlıydı. Liseye sıradan bir vatandaş olarak başlamayı ve lisede huzurlu günler geçirmeyi planlayarak aynı arzuyu paylaşan sınıf arkadaşı Osanai ile gizli bir birlik oluşturdu. Ancak nedense gizemli olaylar ve talihsizlikler ardı ardına gelmeye devam ediyordu. Kobato ve Osanai sıradan vatandaşlar olarak huzurlu günlere ulaşabilecek mi?