Ishikawa Goemon; Lupin, Jigen ve Fujiko'nun soymaya karar verdiği bir mafya patronunun korumasıdır. Lupin, Jigen ve Fujiko insan üstü güce sahip ve durdurulamayan Bermuda Hayaleti isimli adamın hedefi olur. Polis Müfettişi Zenigata ise soruşturma kapsamında Bermuda Hayaletinin peşindedir.