Sonic'in ana gezegeninde Eggman, Kaos Zümrüdü'nün 7'sini de topladı ve Sonic müdahale ettiğinde herkesi kendi dünyasından Dünya'ya gönderen bir patlamaya neden olduğunda mutlak güce sahip olmak üzere. Sonic ve arkadaşları, tüm Kaos Zümrütlerini toplamak ve kötü Dr. Eggman'ı yenmek için 12 yaşındaki Christopher Thorndyke ile birlikte çalışır.