Dijital dünyada büyük-yıkıcı bir savaş çıkmıştır ve bu savaşı Lucemon ile 10 efsanevi savaşçı kendilerini feda ederek durdurmuşlardır. Daha sonralarda barışı sağlamak için dijital dünyayı, üç büyük melek olan Cherubimon, Seraphimon ve Ophanimon yönetmeye başlamıştır. Fakat bir süre sonra Cherubimon asileşerek yeniden savaş başlatır. Böylelikle Cherubimon'un desteği ile yaratık-digimonları ve insan-digimonları birbiriyle savaşmaya başlar. Eskisi gibi efsanevi savaşçılar olmadığı için savaş, dijital dünyayı parçalar ve yok etmeye başlar. Fakat dijital dünyaya giren 5 çocuk, eski savaşçıların ruhları ile temasa geçebilmektedirler ve bu güçleri sayesinde savaşı durdurmak için çalışırlar.