Kurobe Kubbesi'nin yapımı sırasında, çok eski bir aygıt keşfedilir ve de bunun için Birleşmiş Milletler Kurobe Araştırma Enstitüsü kurulur. Dünyanın her bir yanından toplanan bilim insanları bu aygıt üzerinde çalışırlar ve de bu insanların çocukları, enstitünün başının kızı Yukina Shirahane de olmak üzere Tate Dağı Uluslararası Lisesi'ndedirler. 2016'nın yazında, yalnız bir samuray yeniden uyanır.