Naruto ve arkadaşları gizemli Maskeli Shinobi’nin yarattığı Genjutsu’da tuzağa düşerler. Bu yeni dünyada veya gerçeklikte, Naruto ve Sakura dışındaki herkesin kişiliği tamamen değişmiştir. Ayrıca, ölü karakterler de artık canlıdır ve rolleri tersine çevrilmiştir. Naruto ve Sakura bu Genjutsu’dan çıkmanın bir yolunu bulmak ve işleri normale döndürmek zorundadırlar.